Исследователи создали синтетическую органеллу, которая накапливает и сохраняет РНК внутри живой клетки. Благодаря этому по одному позднему анализу можно восстановить след уже закончившегося всплеска активности генов. Работа опубликована 21 октября в Nature Biotechnology.

«Рекорданелла» состоит из одного объединённого белка: он крепится к внешней мембране митохондрий, собирает вокруг себя конденсат и связывает матричные РНК. Оптимизированная версия захватывала молекулы, представляющие до 90% транскриптома, и защищала их от распада в течение нескольких дней. Затем содержимое органеллы можно отделить вместе с митохондриями и прочитать секвенированием.

Команда проверила систему на культивируемых человеческих клетках HEK293T. После краткого воздействия интерферона обычные клетки со временем теряли соответствующую РНК-сигнатуру, а рекорданеллы сохраняли её на уровне отдельных клеток. Без пересевания след был различим как минимум пять дней; при делении клеток старые РНК быстрее разбавлялись новыми, поэтому запись угасала.

В проверенных условиях исследователи не обнаружили существенных изменений жизнеспособности клеток, работы митохондрий, транскриптома и протеома. Это не делает систему полностью нейтральной: экспрессия чужого белка, связывание РНК и конденсаты на митохондриях сами по себе вмешиваются в клетку и могут искажать другие эксперименты. Пока рекорданеллы испытаны в клеточной культуре, а не в ткани или организме; установленный результат — новый способ сохранять молекулярную историю клетки, а не медицинская технология.