Исследователи составили первую комплексную карту взаимодействий почти всех генов, без которых не может выжить *Mycobacterium tuberculosis* — возбудитель туберкулёза. В работе, опубликованной 4 ноября в Nature, они проверили 762 жизненно важных гена и нашли почти 6500 вероятных взаимодействий между ними.

Для этого команда Университета Рокфеллера разработала парную CRISPR-интерференцию: система не вырезает ДНК, а одновременно ослабляет работу двух выбранных генов. Затем исследователи сравнивали рост бактерий с эффектами каждого подавления по отдельности. Если двойное вмешательство вредило сильнее ожидаемого, это указывало на уязвимость, которую потенциально можно атаковать комбинацией препаратов. Оценки взаимодействий в двух независимых картах хорошо совпали — коэффициент корреляции составил 0,82.

Карта воспроизвела известные связи и подсказала новые. Авторы экспериментально подтвердили четыре синергичные пары соединений и одну антагонистическую. В частности, одновременное воздействие экспериментального ингибитора киназ PknA/PknB V49 и применяемого против туберкулёза этамбутола усиливало уничтожение бактерий, тогда как предсказанная антагонистическая пара доклинических соединений мешала действию друг друга. Данные доступны в интерактивной карте, а код анализа — в открытом репозитории.

Это пока не новая схема лечения. Опыты проводили на бактериальных культурах; часть соединений остаётся экспериментальной, а эффект не проверяли на животных или людях. Авторы также предупреждают о ложных взаимодействиях из-за особенностей CRISPR-интерференции и о том, что карта охватывает только жизненно важные гены. Её практическая ценность сейчас — сузить огромный перебор потенциальных комбинаций и выбрать пары для испытаний в условиях, более похожих на инфекцию.