Anthropic 4 ноября сообщила, что её биологическая лаборатория с помощью Claude восстановила трёхмерную структуру необычной белковой капсулы бактериофага — вируса, заражающего бактерии. Частицу L05 получили в кишечной палочке и исследовали криоэлектронной микроскопией. Это представитель семейства vault: похожие полые оболочки известны в клетках человека, но их биологическая функция остаётся неясной.

Родственные белки бактерий и фагов находили раньше. Новое в препринте команды — экспериментальное подтверждение, что они собираются в такие оболочки. У L05 оказалось 96 белковых цепей вместо 78 у человеческой частицы. Добавив повторяющиеся участки стенки, исследователи увеличили внутренний объём ещё примерно на 20%. Получился объект, устройство которого можно целенаправленно менять и изучать в быстро растущих бактериях.

Claude помогал искать родственные последовательности, готовить ДНК-конструкции и обрабатывать микроскопические данные в программе RELION. Исследователи выбирали кандидатов, проводили опыты и направляли анализ. Идею ускорить выделение частиц хроматографией предложили люди; модель сначала возражала, затем помогла подобрать условия. По отчёту лаборатории, процедура заняла около 90 минут вместо обычных трёх дней.

Первая структурная модель была готова за 34 часа, окончательные карты — примерно через неделю. Оценка, что привычная работа заняла бы недели, принадлежит самой команде; для ускорения обработки использовали сотни графических процессоров. Ошибки тоже стоили времени: неподходящая рекомендация Claude по питательной среде задержала эксперименты на две недели, а пропуск стандартного этапа обработки дал искажённую карту, которую пришлось исправлять.

Пока это предварительный результат участвовавшей лаборатории. Препринт представлен, публикация структур и дополнительных данных ещё обещана. Оболочки получили в кишечной палочке; образуются ли они в своих естественных организмах-хозяевах, ещё предстоит проверить. ИИ помог исследовать новый вариант капсулы, но вопрос, зачем такие частицы нужны живым клеткам, остаётся открытым.